Trò chơi đặt bối cảnh trong thời đại hỗn loạn, nơi vô số người dân Trung Nguyên phải chịu đựng khổ nạn, do sự bất ổn và bất an tràn đầy, và câu chuyện bắt đầu từ thời kỳ hỗn loạn này, khiến nhiều tân thủ mới vào trò chơi rất quan tâm đến cốt truyện. Dưới đây là lời giải thích chi tiết về cốt truyện của Yên Vân Thập Lục Thanh, giúp những người bạn chưa trải qua hiểu rõ nội dung cụ thể, từ đó tăng cảm giác tham gia vào trò chơi.

Một, Mở đầu
Mọi người sẽ đóng vai một đứa trẻ mồ côi được nhận nuôi, và câu chuyện bắt đầu tại một nơi gọi là Phòng Khám Người Sống, mọi người sẽ được hướng dẫn bởi NPC lên tầng hai của Phòng Khám Người Sống. Mặc dù mẹ nuôi của nhân vật chính, cô Hàn, đã nói không được vào, nhưng dưới sự thúc đẩy của lòng tò mò, mọi người vẫn tiếp tục khám phá. Ở đây, mọi người sẽ tìm thấy rất nhiều vàng bạc châu báu cùng với một cuốn sổ ghi chép và một chiếc mặt nạ, những manh mối này dường như chứng minh rằng cô Hàn có thể đang giấu một bí mật nào đó. Tiếp tục theo dấu vết đến vị trí tiếp theo, mọi người sẽ phát hiện ra một cái giếng khô bị dây leo che phủ ở phía sau sân.

Hai, Người Không Mặt
Sau khi dùng cung tên đốt cháy dây leo để vào giếng khô, mọi người sẽ phát hiện ra một địa cung bên dưới, nơi có rất nhiều người không mặt vô hồn và con đường dẫn thẳng đến Bờ Yếu Nước. Khi chúng ta liên tục tiến về phía trước và đạt đến điểm cuối của địa cung, chúng ta có thể gặp lãnh tụ của người không mặt và nhận được một cuốn bí lục. Trong quá trình đọc, chúng ta phát hiện rằng đây là thông tin tuyệt mật, nhưng sau khi luyện công pháp trong đó, nhân vật chính lại rơi vào trạng thái hôn mê ảo giác;
Từ ảo giác, chúng ta sẽ bắt đầu với góc nhìn của người không mặt, từ đó biết được rằng những người không mặt đáng sợ này thực chất là các anh hùng tuổi teen, họ mất đi khuôn mặt vì đã trải qua phẫu thuật đổi mặt để trở thành người Khiết Đan và trực tiếp đến doanh trại địch làm gián điệp. Cuối cùng mặc dù thất bại nhưng để không lộ diện, họ chỉ có thể sống suốt đời trong địa cung tối tăm này.

Ba, Bờ Yếu Nước
Khi ra khỏi địa cung, thân phận của cô Hàn luôn làm phiền chúng ta, để giải quyết câu đố này, chúng ta đến phòng của cô Hàn và phát hiện cô ấy không ở trong phòng. Vừa chuẩn bị rời đi thì gặp Ito, và ngoài phòng xuất hiện một nhóm người mặc áo đen muốn tiêu diệt chúng ta. Để sống sót, chúng ta quyết định tạm hợp tác với Ito, ra khỏi nhà và chiến đấu với kẻ thù, hai người cùng nhau dễ dàng đánh bại kẻ thù;
Nhưng để biết được chủ mưu đứng sau vụ việc này, chúng ta quyết định cố gắng giữ lại một người sống, theo dõi anh ta để điều tra. Chúng ta theo chân người mặc áo đen đến một hầm rượu, nhưng anh ta đột nhiên biến mất, chúng ta chỉ có thể tiếp tục đi sâu vào, nhưng lúc này một cánh cửa cơ giới đột nhiên hạ xuống, tách chúng ta và Ito ra.

Bốn, Khám phá
Kế tiếp là việc khám phá một mình, đánh bại kẻ thù trên đường và thoát ra ngoài trời, Ito sẽ cho chúng ta biết cô Hàn dường như đang bảo vệ một bí mật liên quan đến mạng sống của nhiều người. Tiếp tục đi về phía trước sẽ kích hoạt trận chiến với Tâm Ma Tầm Tâm, nhưng Tâm Ma này lại có hình dạng của cô Hàn. Sau khi đánh bại, chúng ta tỉnh dậy và đã theo cô Hàn đến Bất Túc Tiên, chúng ta hỏi cô ấy nhưng không nhận được câu trả lời trực tiếp, chỉ được yêu cầu sao chép sách để suy nghĩ về lỗi lầm.
Năm, Bồ Đề Khổ Hải
Tiếp tục khám phá và đến Bồ Đề Khổ Hải, chúng ta sẽ gặp boss Diệp Vạn Sơn, anh ta có hai giai đoạn rất khó đánh. Sau khi đánh bại thành công, chúng ta cũng sẽ vào ảo giác giống như người không mặt. Từ ảo giác, chúng ta cũng biết rằng đây là một nhân vật phức tạp, anh ta từng là tướng Thiết Tâm của Liên Minh Yên Bắc, ngay cả khi bị quân Khiết Đan dùng vợ con để uy hiếp cũng không từ bỏ việc thủ thành;
Luôn kiên trì thủ thành đến tận phút cuối cùng, mặc dù cuối cùng vẫn phải chạy trốn vì thiếu quân lực, nhưng sau nhiều năm, anh ta vẫn tiếp tục đề nghị triều đình tấn công phương Bắc, nhưng do triều đình luôn viện lý do chưa đúng thời điểm nên cuối cùng anh ta bị tức giận che mờ lý trí, dẫn theo thuộc hạ giả vờ là người Khiết Đan, chặt chém người dân Trung Nguyên vô tội để kích động triều đình phát động chiến tranh.

Lời giải thích chi tiết về cốt truyện của Yên Vân Thập Lục Thanh tạm dừng ở đây. Cốt truyện của trò chơi này sử dụng nhịp độ kể chuyện phân mảnh, tích hợp từng đoạn cốt truyện vào cách chơi khám phá, từ đó mọi người có thể cảm nhận được nỗi oan uổng của Diệp Vạn Sơn bị triều đình yếu đuối phụ bạc, và sự hy sinh vô tư của người không mặt, v.v., trải nghiệm qua hình thức ảo giác những câu chuyện đầy biến động.