Im Spiel übernimmt der Spieler die Rolle eines Fischers, der von den Bewohnern einer abgelegenen Insel gerettet und mit einem neuen Fischerboot ausgestattet wird, um sein Abenteuer zu beginnen. Da die Spieler am Anfang nur sehr begrenzte und fragmentierte Hintergrundinformationen erhalten, gibt es viele, die das Handlungsszenario von "Fishing and the Dark Tides" nicht verstehen. Im Folgenden werden die relevanten Hintergrunddetails aufgearbeitet, damit alle eine Vorstellung davon bekommen und sich tiefer in diese Welt einfinden können.

Der Protagonist kam an einem Tag vor 1927 in Kontakt mit einem Steinsäulen, wo er zwar eine Prophezeiung sah, aber auch verführt wurde. Danach nahm er seine Verlobte mit, um die Nordlichter zu sehen, und konnte ihr erfolgreich einen Heiratsantrag machen. Einige Zeit später starb die Mutter des Protagonisten und hinterließ seiner Verlobten eine Taschenuhr, die eines der fünf großen Sammelobjekte im Spiel ist.

Es wird angenommen, dass der Protagonist im Hintergrund bereits von bösen Kräften beeinflusst war und seine Verlobte als Opfergabe für das Meer betrachtete. Nach ihrer Hochzeit wurde der Einfluss der mysteriösen Kräfte auf den Protagonisten stärker, doch gleichzeitig begann er, sich dagegen zu wehren und zu kämpfen. Er gab seinen ursprünglichen Plan, seine Frau zu opfern, auf und beschloss stattdessen, ein Schiff mit dem Namen seiner Frau als Ersatz zu benutzen.

In ihrem Tagebuch äußert die Hauptfrau, dass ihr Mann sie nicht mit aufs Boot nehmen will. Der Hauptmann scheint dies, um sie zu schützen, getan zu haben, aber die Frau entscheidet, ihn davon zu überzeugen, sie mitzunehmen. Aus den Worten des Sammlers im Spiel "Finde ihr letztes Relikt, um deine Schuld wiedergutzumachen" lässt sich schließen, dass der Hauptmann sie letztendlich doch mitnahm.

Die beiden hatten einen Unfall auf dem Schiff "Julie", wodurch die Hauptfrau Julie vom Meer verschlungen wurde. Der überlebende Hauptmann entwickelte selektives Gedächtnisverlust und eine dissoziative Persönlichkeit, den Sammler. Während dieser Zeit vergaß er niemals sein Bedauern und den Wunsch, sie wiederzubeleben, was ihn dazu trieb, ins Meer zurückzukehren - also unsere Einführung als Spielfigur zu Beginn des Spiels.

Damit endet die Erläuterung zum Handlungsszenario von "Fishing and the Dark Tides". Diese Hintergrundgeschichte wird nicht von Anfang an präsentiert, sondern wird durch unser Fortschreiten im Abenteuer und die Aneignung einzelner, verstreuter Hinweise allmählich enthüllt. Wer Interesse an diesem Handlungsstrang hat, sollte das Spiel selbst erleben.